1、消毒需要時間
一般情況下，高溫消毒時，60℃就可以將多數病原殺滅，但汽油噴燈溫度達幾百度，噴燈火焰一掃而過，也不會殺滅病原，因時間太短。蒸煮消毒：在水開后30分鐘卻可以將病原殺死。紫外線照射：必須達到5分鐘以上。
注意：這里說的時間，不單純是消毒所用的時間，更重要的是病原體與消毒藥接觸的有效時間。因為病原體往往附著于其他物質上面或中間，消毒藥與病原接觸需要先滲透，而滲透則需要時間，有時時間會很長。
這個時候我們可以把一塊干糞便放到水中，看一下多長時間能夠浸透。
2、消毒需要藥物與病原接觸
在產房消毒不會把保育舍的病原殺死，同樣在產房，消毒藥噴不到的地方，病原也不會被殺死，消毒育肥舍地面時，如果地面有很厚的一層糞，消毒藥只能將最上面的病原殺死，而在糞便深層的病原卻不會被殺死，因為消毒藥還沒有與病原接觸。所以我們要求豬舍消毒前要先將豬舍清理沖洗干凈，就是為了減輕其他因素的影響。
3、消毒需要足夠的劑量
消毒藥在殺滅病原的同時往往自身也被破壞，一個消毒藥分子可能只能殺死一個病原，如果一個消毒藥分子遇到五個病原，再好的消毒藥也不會有效果。關于消毒藥的用量，一般是每平方米面積用1升藥液。生產上常見到的則是不經計算，只是在消毒藥將舍內全部噴濕即可，人走后地面馬上干燥，這樣的消毒效果是很差的，因為消毒藥無法與掩蓋在深層的病原接觸。
4、消毒需要沒有干擾
許多消毒藥遇到有機物會失效，如果使用這些消毒藥放在消毒池中，池中再放一些鋸末，作為鞋底消毒的手段，效果就不會好了。
5、消毒需要藥物對病原敏感
不是每一種消毒藥對所有病原都有效，而是有針對性的，所以使用消毒藥時也是有目標的。如預防口蹄疫時，碘制劑效果較好，而預防感冒時，過氧乙酸可能是首選，而預防傳染性胃腸炎時，高溫和紫外線可能更實用。
注意：沒有任何一種消毒藥可以殺滅所有的病原，即使我們認為最可靠的高溫消毒，也還有耐高溫細菌不被破壞。這就要求我們使用消毒藥時，應經常更換，這樣才能起到最理想的效果。
附：豬場可以使用生石灰消毒嗎?
生石灰的主要成分是氧化鈣,消毒是靠氧化鈣溶于水后生成氫氧化鈣并放出大量的熱。氫氧化鈣是強堿,會提高被消毒物的pH值,破壞細菌的生長環境,使細菌不能生長,從而達到消毒目的。同時,大量放熱會造成局部高溫,有殺菌效果。所以豬場可以使用生石灰消毒。
消毒方法
豬場場用生石灰消毒通常用其10%-20%乳劑。具體配制方法是:取1公斤石灰加1升水生成熟石灰,將所得的熟石灰再加9升水即成10%石灰乳。
消毒可以趁圈舍內的豬出欄后,把地面和墻面沖刷、清掃干凈,將墻壁和地面,每平方米用1升石灰乳刷1-3次；用新鮮熟化的石灰粉撒布于豬舍周圍陰濕的道路、地面、污水溝以及糞池周圍。
注意事項
生石灰遇水才會發生消毒作用,直接撒布于干燥地面不發生消毒作用；
生石灰必須現配現用,久置會變質而失去殺菌消毒作用；
石灰中含有雜質,加水過程中可能引起燃燒和爆炸,要特別注意個人防護。
配制時,要做好防護措施,戴口罩、橡膠手套,然后將生石灰按照比例慢慢的撒入水中,輕輕攪拌；用生石灰消毒前,應將要消毒地點進行一次垃圾清理后再消毒,清理的垃圾要進行堆制,上面用20%石灰乳澆潑進行消毒,不讓帶病菌的垃圾傳播擴散。
常見錯誤
有的養殖戶將熟石灰粉直接撒在廄舍內的地面上,這樣做很容易將豬蹄肢及皮膚灼傷,豬吃了落在地上的食物后,也容易灼傷口腔及消化道。另外在撒石灰粉時會造成石灰粉塵大量飛揚,使豬吸入呼吸道內。
還有不少的養殖戶為了圖省事,一次性購進較多的生石灰,長期使用,這是不正確的使用方法。生石灰容易吸收水份變成熟石灰,而熟石灰放置時間較長的話,會失去殺菌消毒的功能。
也有養殖戶在入口處不設置消毒室,而是撒上一層熟石灰。但是如果熟石灰不經常更換的話,工作人員仍有可能把病菌帶入到養殖場中。因此,應在豬舍的入口處設置消毒室,并在消毒池中放入生石灰,生石灰要經常更換。
